-my blogpost- protein, juga menentukan jarak pergerakan di dalam matrik gel tersebut. Pergerakan protein akan lambat apabila pergeseran molekul meningkat -my blogpost- akibat dari bertambahnya diameter; dengan demikian, protein yang lebih kecil bergerak lebih cepat di dalam matrik gel. -my blogpost- Bagitu juga, pengurangan ukuran pori (pore) matrik gel akan memperlambat pergerakan.-my blogpost-
Didalam elektroforesis nondenaturing atau elektroforesis natif, protein dipisahkan dalam bentuk aslinya-my blogpost- berdasarkan muatan, ukuran, dan bentuk molekul tersebut. Elektroforesis gel poliakrilamid (PAGE) dengan suatu detergen anion, sodium dodesil sulfat -my blogpost- (SDS) digunakan untuk memisahkan subunit protein berdasarkan ukuran. Protein dilarutkan di -my blogpost- dalam suatu larutan penimbal yang mengandung SDS dan agen penurun, merkaptoetanol atau ditiotreitol, untuk memisahkan protein menjadi subunit dan -my blogpost- menurunkan ikatan disulfat. Protein bergabung dengan SDS lalu bermuatan negartif, dan dipisahkan hanya berdasarkan ukurannya.-my blogpost-
